一是案件的类别不同。

刑事控告的案件一般都是公诉案件。而刑事自诉案件是属于自诉案件类别。

二是提起诉讼的机制不同。

刑事控告案件一般要通过检察机关提起公诉。而刑事自诉案件可以由公民个人提起诉讼。

三是私了情况不同。

刑事控告案件不能私了，而刑事自诉案件则可以私了。