建行ETC和支付宝ETC都是电子不停车收费系统，但两者的使用方式和功能略有不同。

建行ETC是建设银行发行的电子不停车收费系统，可以通过申请建行ETC卡片并安装在车辆上实现高速公路、城市快速路等路段的电子收费，支持在多个省份和城市的道路上使用。

支付宝ETC是支付宝推出的一种虚拟ETC卡片，使用方式与实体ETC卡类似，但无需申请实体卡片，只需在支付宝内完成ETC卡片的绑定、充值、查询等操作，就可以在支持ETC的高速公路和城市道路上实现电子不停车收费。

从使用方便性和操作方式上来看，支付宝ETC相对于实体ETC更加便捷，可以实现在线充值、一键开通等功能，无需申请实体卡片，而且在支付宝内也可以查询相关信息。但是需要注意的是，支付宝ETC目前仅支持部分ETC免费通行政策，具体情况可以参考支付宝ETC使用说明。