从广州塔码头到黄沙码头，您可以选择乘坐水上巴士S2线路。根据提供的参考信息，S2线路的运营时间没有明确的说明，但通常情况下，类似的水上巴士线路会在白天正常运营，具体的时间可能需要根据实际情况查询当地的公共交通信息。

为了获取最准确的班次信息，建议您可以通过广州市的官方公交信息查询渠道，比如广州市公交集团官方网站或者相关的手机应用程序，如“广州地铁”APP等，这些平台通常能够提供实时的公交班次信息，包括水上巴士的运营时间。此外，您也可以直接前往广州塔码头询问工作人员，他们会提供最准确的乘船时间和班次信息。

在规划出行时，请留意末班船的时间，确保您能够在末班船出发前到达码头，以免错过最后一班船。根据提供的参考信息，末班船的时间是18点30分，您需要在这个时间之前到达黄沙码头。在实际出行前，请再次确认班次时间，因为公共交通的运营时间可能会有调整。