学位论文查重通常包括摘要和致谢部分，因为这两个部分也是论文的重要组成部分。论文查重的目的是为了确保论文的原创性和防止学术不端行为。通常情况下，查重软件会对论文的全部内容进行比对，包括摘要、正文、致谢、参考文献等部分。

然而，不同学校和机构对论文查重的规定可能会有所不同。有些学校或机构可能会要求排除摘要和致谢部分，以便这些部分不被标记为重复。因此，建议您在进行论文查重之前，详细阅读学校的规定或咨询导师，以确保您按照规定的要求进行查重。

在撰写论文的过程中，要保持原创性，避免直接抄袭或过度引用他人的作品。同时，注意对摘要和致谢部分的撰写，确保它们能够真实地反映您的研究成果和感谢对象，展现出您的学术素养和尊重他人的态度。