碘晶体中分子的取向有两种，即平行和垂直于晶格面的取向。每个碘分子都和周围的分子形成分子间相互作用力，这种作用力被称为范德华力，使得分子会在晶格点处定向排列。

这种定向排列使得一部分分子平行于晶格面排列，而另外一部分分子垂直于晶格面排列。这种分子的取向是由晶体的对称性和范德华力的性质所决定的。在碘晶体中，分子的取向不仅影响晶体的化学性质，还影响其物理性质和光学性质。