氨基寡聚糖与氨基寡糖素虽然名字相似，但在化学结构和生物活性上存在一些区别。氨基寡聚糖是一类由多个氨基糖单体通过糖苷键连接而成的聚合物，具有较高的分子量和较复杂的结构。而氨基寡糖素则是氨基寡聚糖的分解产物，其分子量较小，结构相对简单。

在生物活性方面，氨基寡聚糖因其独特的结构和理化性质，具有更好的生物相容性和生物活性，在医药、生物材料等领域有广泛的应用。

而氨基寡糖素则因其较小的分子量和特定的官能团，在某些特定的生物反应中起到独特的作用。总的来说，两者虽有关联，但在化学结构和生物活性上各有特点。