起源不同。怀石料理起源于日本茶道，是一种修行方式的一部分，而京料理则起源于日本古代宫廷烹饪，是宫廷贵族享用的美食。
食材和烹饪方式不同。怀石料理通常使用高级食材，如松茸、金枪鱼、鲍鱼等，烹饪方式也比较复杂，采用蒸、煮、烤等多种方式，注重保留食材的原味和营养。而京料理则使用较为普通的食材，如鸡肉、猪肉、豆腐等，烹饪方式也较为简单，采用煮、炸、烤等方式，注重调味和色泽。
餐具和摆盘不同。怀石料理通常使用精美的陶瓷餐具，摆盘也非常讲究，讲究美观和意境。而京料理则使用较为朴素的餐具，如金属碗、盘等，摆盘也较为简洁。
总的来说，怀石料理更注重食材的品味和营养，而京料理更注重调味和色彩。