要取出深圳通卡里的余额，可以到深圳通服务网点或者银行柜台进行查询和取款。在网点或者银行柜台，持卡人可以使用身份证和深圳通卡对卡进行验证，然后告知工作人员要取出的金额，工作人员会在系统中进行操作并将相应金额存入持卡人的银行账户。

另外，也可以通过深圳通App进行余额查询和取款操作，持卡人只需在App中输入账户信息和取款金额即可完成取款操作。需要注意的是，取款时可能会收取一定的手续费，具体以当地规定为准。