- 案件性质不同：行政处罚是指行政主体依照法定职权和程序，对违反行政法规范但尚未构成犯罪的相对人，给予行政制裁的具体行政行为。刑事自诉案件要给予的是刑事处罚。
- 提起诉讼的主体不同：行政处罚由行政相对人，利害关系人提起，行政主体没有起诉权和反诉权。刑事自诉案件由受害人提起，公诉案件由检察机关代表国家提起。
- 适用法律依据不同：行政处罚以行政实体法、行政程序法和行政诉讼法为依据。刑事自诉案件以宪法、刑法和刑事诉讼法、最高人民法院和最高人民检察院解释为依据。
- 审理对象及判决不同：行政诉讼主要是法律审，法院审理的重点是被诉具体行政行为的合法性，有权作出维持、撤销判决、强制履行和有限的变更判决，但通常不对当事人在行政法上的权利义务直接作出判决。刑事诉讼既是事实审，又是法律审，针对刑事责任的有无分为有罪判决、无罪判决及免除刑事责任判决。
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