购买房屋时，如需签订顶楼补充协议，应在双方签署合同前明确规定协议条款：比如顶楼加建是否符合建筑法规、用途是否合法合规、权属是否清晰等。

协议还应明确顶楼的售后服务和维修责任，防止可能发生的争议。在签署协议之前，务必详细核实合同内容和补充协议的条款，保护自身权益，防范风险。