药材籽堵塞的问题可能由多种因素造成，解决这个问题需要综合考虑种植、管理和收获过程中的各个环节。以下是一些可能的解决措施：

1. 土壤管理：确保土壤排水良好，避免水分过多导致种子腐烂。定期翻土，保持土壤疏松，有利于种子呼吸和生长。

2. 种子处理：在播种前对种子进行适当处理，如浸泡、催芽或消毒，可以提高种子发芽率，减少堵塞现象。

3. 播种深度：控制合适的播种深度，过深可能导致种子难以发芽，过浅又容易被风吹走或受到外界干扰。

4. 施肥和灌溉：合理施用肥料，避免过量施肥导致土壤过于湿润。灌溉时要均匀，避免局部积水。

5. 杂草控制：及时除草，减少杂草与药材籽竞争水分和养分。

6. 病虫害防治：定期检查植株，发现病虫害及时处理，防止病虫害蔓延导致种子损坏。

7. 收获时机：选择适宜的收获时间，避免因过早或过晚收获导致种子品质下降。

8. 储存条件：确保种子储存环境干燥通风，防止受潮发霉或被害虫侵扰。

通过这些措施，可以有效减少药材籽在种植过程中的堵塞问题，提高药材的产量和质量。如问题持续存在，建议咨询当地农业技术推广部门或专业人士进行具体诊断和指导。