苜蓿菜有转基因的也有非转基因的。

非转基因苜蓿是指遗传信息没有被改变过的苜蓿，具有自然生长、不使用任何化学农药、营养成分非常均衡、相对稳定和安全等特点。

转基因苜蓿是通过现代分子生物技术，将某些生物的基因转移到苜蓿中，使其出现原物种不具有的性状或产物，以转基因生物为直接食品或为原料加工生产的食品就是转基因食品。