如果海关查到活体非法入境，处理方式将取决于入境者的情况和所处国家的法律规定。一般情况下，入境者可能会被拘留并接受身份确认和调查。如果入境者被确认为非法入境者，他们可能会被遣返回原国家或被判处罚款和/或监禁。

此外，如果入境者涉及非法贸易或其他犯罪活动，他们可能会面临更严重的后果，例如长期监禁或流放。