小吃店营业执照不会自动注销，需要经营者主动申请注销或因违规等原因被部门责令注销。如果小吃店长期未经营或未按规定缴纳税费、公共服务费等，也有可能被相关部门注销。在经营期间，业主需要按时完成各项手续和报告，并保持合规经营，否则可能面临执照注销和行政处罚等情况。因此，业主需要时刻关注执照有效期和相关规定，合理规划经营计划，确保小吃店平稳运营。