按扣率分账是商家与支付机构之间的一种分账方式。具体而言，商家根据与支付机构的协议，将销售额分成两部分：一部分归商家所有，另一部分按扣率收取，然后将这部分费用付给支付机构。

这种方式可以方便商家与支付机构的结算，在减少手续费方面也具有一定作用。同时，根据扣率的不同，商家也可以选择最优的分账方式以降低成本。