肇庆市交通局发出的水工证明书是证明持有人具有水工技能的证书，主要用于以下方面：

1. 就业：持有水工证明书的人员可以在水利工程、港口码头等领域从事相关工作。

2. 考试：持有水工证明书的人员可以参加与水工相关的考试，如水利工程师、港口工程师等。

3. 培训：一些培训机构会要求学员提供水工证明书作为报名条件。

4. 出国留学：一些国家对留学生的专业要求较高，持有水工证明书可以增加留学申请的成功率。

总之，水工证明书是水利工程领域的重要证书，对于从事相关工作的人员来说具有重要的意义。