回答如下:

朝阳区小店村社区医院是不能办健康证的。

健康证的办理一般只能在疾病预防控制中心,社区的卫生站只能做普通的体检,没有资格办理健康证。

办健康证要到所在地的疾病预防控制中心进行交费,然后抽血化验,体检合格以后就会办。