自留地不能建房的原因主要有以下几点。

首先，自留地是农村集体经济组织按照政策规定分配给成员长期使用的土地，主要用于农业生产和农民生活，其使用权归农户，所有权仍属集体所有，因此，农户不能随意改变其用途，包括用于建房。

其次，自留地建房可能违反土地利用总体规划和城乡规划，破坏土地资源和生态环境，影响农业生产和农民生活。

最后，自留地建房还可能涉及违法用地和违规建设等问题，可能面临行政处罚和法律纠纷。因此，为了保障农村土地资源的合理利用和农民权益，自留地不能用于建房。