淘宝跨店满减活动在结算时会自动减免。用户只需在参加满减活动的店铺中购买商品，满足满减条件后，系统会在结算时自动减去相应的优惠金额。

需要注意的是，满减条件可能包括商品金额、店铺数量等具体要求，用户在购物时需要仔细阅读活动规则，确保自己的购物行为符合满减条件。此外，部分商品可能不参加满减活动，用户在购物时需要注意筛选。

如果在结算时发现没有自动减免满减金额，可以检查购物车中的商品是否都参加了满减活动，或者联系淘宝客服寻求帮助。