北京协和医学院的本科专业是生物学、生物医学工程、临床医学、药学等是本科专业。据2020年9月学校官网显示，学校设有6所医院、7个学院，含有国家重点一级学科2个、博士学术学位一级学科授权点7个、硕士学术学位一级学科授权点3个、本科专业2个。