深圳市南山区医保卡可以在其他区使用。但是需要先进行备案，备案成功之后在异地使用深圳的医保卡可以直接刷卡结算。需要注意的是，必须在定点机构医院才能申请报销。若是没有备案，去异地看病，需要带上材料回参保地申请报销。