16 周岁的未成年人把同学的门牙磕断了，需要进行相应的赔付。具体的赔付方式可能会受到多种因素的影响，以下是一些可能的步骤和考虑因素：

及时道歉：向受伤的同学诚恳地道歉，表达自己的歉意和愿意承担责任的态度。

承担医疗费用：支付同学的门牙修复或治疗费用，包括看牙医、补牙或其他相关的医疗费用。

考虑赔偿其他损失：除了医疗费用，还可能需要考虑赔偿其他相关的损失，例如因门牙受损而导致的疼痛和不适、可能的美容修复费用等。

与家长或监护人沟通：及时与双方的家长或监护人进行沟通，共同协商解决方案。他们可以一起探讨赔偿的具体金额和方式。

考虑协商和解：可以尝试通过协商和和解的方式解决问题。可以与对方家长或监护人商量，达成双方都能接受的赔偿协议。

寻求法律帮助（如有必要）：如果无法通过协商解决争议，可能需要寻求法律帮助或咨询专业律师的意见。

学习教训：这是一个教育的机会，让 16 周岁的当事人认识到自己的行为所带来的后果，并从中吸取教训，避免类似情况的再次发生。

需要注意的是，具体的赔付金额和方式可能会因地区、法律规定和具体情况而有所不同。在处理这种情况时，尊重和关心受伤同学的感受是非常重要的，同时也要遵循法律和道德的原则。最好的解决方式是通过诚实、负责任的态度与对方进行沟通和协商，以达成公平和可接受的解决方案。同时，学校或相关机构可能也有相应的规定和程序，需要遵守和配合。