新农合医保异地就医自费后，可以通过以下步骤进行报销：

1. 准备好激活好的医保卡，电话咨询医保缴纳所在地的人力保障局，进行备案。

2. 备案后，可以立即在就医医院缴费处办理自费转医保。

3. 携带病历复印件，住院产生的医疗费用汇总和明细，在医院住院的收费票据，患者的身份证，出院的证明，外出务工证明，合作医疗证明等到参保地进行报销。

以上信息仅供参考，具体步骤请以实际情况为准。